A utilização de biodiesel vem crescendo em diversos países, devido principalmente às suas contribuições ao meio ambiente. O biodiesel é derivado de fontes renováveis, o que reduz a dependência do petróleo; é biodegradável; reduz a emissão de diversos gases causadores do efeito estufa, com exceção de óxidos de nitrogênio.O biodiesel pode ser obtido através de óleos vegetais ou de gorduras animais. Atualmente, o processo mais utilizado para a produção desse combustível é a transesterificação que consiste na reação do óleo ou gordura com um álcool, em presença de um catalisador. Em tese, qualquer matriz rica em lipídeos pode ser utilizada na obtenção do biocombustível. Por esse motivo, as microalgas estão sendo consideradas potenciais fontes para a produção de biodiesel.
Considerando-se todos os fatores que influenciam na eficiência da fotossíntese, torna-se crucial conhecer como cada um deles influencia na taxa de conversão energética da espécie da microalga, incluindo entre eles o teor de CO2, o ponto máximo de saturação de luz para a produção fotossintética e o comportamento metabólico sob diferentes condições de luminosidade e densidade populacional, o que exige acompanhamento constante, a fim de evitar danos ao mecanismo fotossintetizante. Além disso, as microalgas são os organismos mais eficazes no processo de conversão da energia luminosa em energia química. Crescem rapidamente e são eficientes conversores de energia solar e produzem muito mais biomassa por unidade de área de terra plantada quando comparada com plantas terrestres e, não necessitam de áreas aráveis ou de água potável, não competindo, dessa forma, com a agricultura, animais ou pessoas.